昭和末年，年轻的钢琴师博于日本银座的歌厅演奏，一边寻找爵士乐真谛。在神秘帮派分子的怂恿下，博弹奏起电影《教父》的主题曲〈Love Theme〉，未料这首曲子有个广为人知的禁忌：统治银座地下世界的帮派首领，只允许他最锺爱的钢琴师南弹奏此曲。一首乐曲的演奏，意外牵连两个钢琴师的命运，也揭开银座夜晚谜样的序幕。...

漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑...